A INCUBACOOP/UFLA foi criada com o objetivo de assessorar a constituição e funcionamento de cooperativas populares com vista ao desenvolvimento do município de Lavras e da região, no intuito de gerar trabalho e renda, conjugando pessoas, recursos financeiros e materiais da Universidade Federal de Lavras no âmbito do ensino, da pesquisa e da extensão universitária.
A Incubadora Tecnológica de Cooperativas Populares da Universidade Federal de Lavras (INCUBACOOP/UFLA) foi aprovada como associada à Rede Nacional de ITCP’s, no encontro nacional realizado em Natal-RN, entre os dias 20 e 23/09/2005, organizado pela Incubadora da Universidade Federal do Rio Grande do Norte. Após esse encontro, foi elaborado um projeto de criação da INCUBACOOP/UFLA, pelo professor José Roberto Pereira, definindo objetivos, estrutura de funcionamento e metodologia de incubação. Esse projeto foi submetido ao edital do PRONINC de 2006 e foi aprovado em novembro do mesmo ano. Ainda em 2005, o professor José Roberto Pereira lançou um edital para seleção de 20 estagiários voluntários (edital PROEX 001/2005, de 29 de abril de 2005).
Por meio da Pró-Reitoria de Extensão da UFLA, hoje Pró-Reitoria de Extensão e Cultura (PROEC), a INCUBACOOP selecionou estudantes dos cursos de Administração, Agronomia, Biologia, Engenharia florestal e Ciência da Computação, contando, atualmente, com uma equipe multidisciplinar de 12 estudantes, orientadores e professores voluntários de diversas áreas do conhecimento. A incubadora está sediada no Departamento de Administração e Economia (DAE), ocupando um espaço físico de 30 m² com equipamentos adquiridos com recursos do PRONINC e outros doados pelo DAE.
Além disso, a INCUBACOOP/UFLA é um órgão integrante da estrutura organizacional na Pró–Reitoria de Extensão e Cultura (PROEC), fazendo parte da Coordenadoria de Desenvolvimento Tecnológico e Social; CODETS, da UFLA.